細胞污染在細胞培養過程中，非常常見。目前為止，防止細胞污染的首要手段是預防。細胞污染通常會出現在生物安全柜和培養箱這兩個地方，因此，如何做好這兩個地方的預防措施呢？
一、所有進入安全柜的東西都要盡可能保證無菌
直接購買商用試劑和耗材是穩定的方式，如Gibco、中科百抗的血清，Corning的耗材等，這些品牌的試劑和耗材一般只要是正品都可以保證無菌。若自己配制的試劑，那么在配制中需要嚴格按無菌操作進行。
二、分裝的試劑建議過濾一次
試劑在分裝時可以考慮再用針頭式過濾器過濾一次，減少污染的可能性。
三、安全柜每次使用前需要滅菌、換氣
生物安全柜在每次使用前需要紫外照射30min滅菌，然后通風5min以上保證換氣到位。
四、實驗過程中注意試劑的封蓋問題
實驗過程中所有試劑不用時需要蓋上瓶蓋，瓶蓋打開時除了干凈的吸頭，其他任何東西都不要從瓶口的上方經過。如果使用培養皿培養細胞，則處理時不要長時間打開皿蓋。
五、培養皿培養細胞操作要輕柔
如果使用培養皿培養細胞，放入培養箱前搖勻時要輕柔，不要將培養基搖到皿蓋和皿身的間隙中，這樣在細胞生長時很容易污染。
六、及時清理污染的細胞
晚期污染則是細胞形態發生明顯改變，細胞停止生長，顯微鏡下可見大量微生物。這時候建議大家及時清理掉相關細胞，以免污染其他細胞。在對安全柜和培養箱進行消毒后，再重新復蘇早批次的細胞。
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