蛋白Marker被稱為蛋白質質量標定劑，是一種由已知分子質量的蛋白質混合物構成的，類似于"尺寸"的工具，用于指示蛋白質條帶的大小。下面讓我們一起來看看非預染蛋白Marker和預染蛋白Marker的區別吧！
非預染蛋白Marker：
是幾種已知分子量并純化好的蛋白質預混液，方便不同大小的蛋白比較。非預染的Marker使用上不如預染Marker好用，因為電泳過程中看不到，電泳結束后經過蛋白染色后才能起指示作用，無法在實驗過程中起預示參照作用，屬于“后知后覺”型的。但是由于蛋白沒有附帶染料分子或者是標記分子，所示大小正好是蛋白原本的大小，所以比較準確，可以精確判斷蛋白大小。
預染蛋白Marker：
預染蛋白Marker的出現方便了我們的實驗，這種蛋白分子量標準可以幫助我們在電泳時、電泳后，以及轉膜后監測電泳情況和估計遷移率——比如，已知垂直電泳最佳分辨區域大約在膠的2/3處，如果使用預染Marker就可以預測目標蛋白進入最佳分辨區時停止電泳以得到最佳分辨效果；如果觀察到Marker電泳異常也可以及時終止電泳；另外在Western Blot轉膜以后可以直接觀察蛋白轉膜是否**，還可以在膜上標記蛋白分子量，所以吸引了許多實驗室人員購買預染蛋白標準。
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