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質譜法基因分型技術簡介
DNA質譜陣列基因分析系統以其通量高、自動化、靈活、結果準確、實驗成本低廉等諸多優勢成為了大學、醫學生物學研究所、生物技術公司、制藥企業、疾控中心等機構所推崇的研究工具。應用領域涵蓋醫學及轉化醫學、分子生物學、基因組學、表觀遺傳學、農業遺傳育種及轉基因技術等相關領域。
檢測儀器信息
Sequenom MassArray時間飛行質譜生物芯片系統是為基因組學研究提供兼顧靈敏度和特異服務的中高通量技術平臺，廣泛地應用于遺傳突變檢測、SNP分型以及DNA甲基化定量分析研究，是目前唯yi采用質譜法進行直接檢測的設備。
Sequenom MassArray系統反應體系為非雜交依賴性，不需要各種標記物，實驗設計靈活，更可實現高達40重反應，是目前市場上擁有高性價比的產品。
Sequenom MassArray特定SNP位點檢測服務采用專業的引物設計和基因分型軟件，可對95%以上已被證實的SNP進行實驗設計，特別適合于SNP位點小于200個，樣本量大于500份的項目。實驗過程無需熒光標記，大大降低每次基因型分析的成本。
檢測原理
Sequenom MassARRAY® 分子量陣列技術是Sequenom 公司推出的世界上的基因分析工具，通過引物延伸或切割反應與靈敏、可靠的MALDI-TOF質譜技術相結合，經過PCR擴增,SAP酶處理, 延伸引物單堿基延伸,樹脂除鹽純化, 芯片點樣, 質譜檢測等實驗步驟，終使用Typer4.0 軟件分析實驗數據，獲得基因分型結果。
具體原理：Sequenom MassArray系統主要是利用基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜 (MALDI-TOF MS) 進行分析，即PCR擴增產物或者預處理樣本在延伸單堿基后，將制備的樣品分析物與芯片基質共結晶，將該晶體放入質譜儀的真空管，而后用瞬時納秒 (10-9s) 強激光激發，由于基質分子經輻射所吸收的能量，導致能量蓄積并迅速產熱，從而使基質晶體升華，核酸分子就會解吸附并轉變為亞穩態離子，產生的離子多為單電荷離子，這些單電荷 離子在加速電場中獲得相同的動能，進而在一非電場漂移區內按照其質荷比率得以分離，在真空小管中飛行到達檢測器。
檢測應用
中高通量SNP基因型分析
GWAS及二代測序驗證
腫瘤體細胞基因突變譜分析
基因表達定量及目標基因CNV分析
DNA甲基化定位定量
病原體分子分型
技術優勢
定制靈活：可以自由選擇感興趣的SNP位點一張芯片上，樣本的數量和位置可以自由選擇一張芯片上，樣本和SNP位點的配對可以自由選擇。
分析準確：直接檢測待測物分子量，準確度超過99.7%。質譜技術靈活檢測PCR實驗失敗或三等位基因的存在。可重復性高，每個樣品將要檢測到SNP位點適合精細定位和芯片實驗的后續研究。
高通量檢測：一張芯片上可完成384個樣品的多重iPLEX GOLD實驗；每個反應孔高可實現多達40重反應；每天可進行高達十萬次基因型分析。
檢測服務流程
1、客戶提供DNA或者生物樣本，并需要檢測SNP位點(rs編號)
2、設計引物(包括PCR擴增引物和單堿基延伸引物)
3、樣本制備PCR擴增、SAP處理、單堿基延伸
4、點樣制備檢測用芯片陣列
5、MALDI-TOF質譜檢測
6、數據分析、給出分型報告
樣本要求
基因組DNA: 總量大于10 ng（視檢測位點數量遞增）
A260/280在1.8-2.0
A260/230大于1.8
服務流程
1、提交項目課題相關需求和資料。
2、與我們的專業技術團隊討論項目細節。
3、根據討論后的意見對實驗方案進行修改。
4、雙方均滿意并達成一致，簽訂技術服務合同。
5、開展實驗，按期完成合同規定的內容。
6、結題，提供實驗原始結果和分析結果、實驗流程、實驗條件等等。
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